মালশন গিরিগ্রাম উচ্চ বিদ্যালয়ে শিক্ষার্থীদের শিক্ষাগত অগ্রগতি ও মূল্যায়নের জন্য সেমেস্টার ভিত্তিক ব্যবস্থা রয়েছে। প্রতি সেমেস্টারে শিক্ষার্থীদের বিষয়ভিত্তিক পাঠ্যক্রম, অভ্যন্তরীণ মূল্যায়ন এবং প্রজেক্ট কার্যক্রম পরিচালিত হয়। এই সেমেস্টার ব্যবস্থা শিক্ষার্থীদের ধারাবাহিকভাবে জ্ঞান অর্জন, দক্ষতা উন্নয়ন এবং পরীক্ষার প্রস্তুতিতে সহায়ক। শিক্ষকবৃন্দ নিয়মিত শিক্ষার্থীদের অগ্রগতি পর্যবেক্ষণ করে, যাতে তারা সঠিক দিকনির্দেশনা ও পরামর্শ পেতে পারে।